Mayonaka no X Giten là câu chuyện về một cô gái tên là Akane, một học sinh trung học bình thường nhưng bị cuốn vào một vụ án mạng kỳ bí. Sau một vụ giết người đẫm máu xảy ra vào buổi tối, cô bất ngờ thức dậy và phát hiện mình đã điều chuyển vào cơ thể của một chàng trai tên là Ren trong đêm đó. Từ đó, Akane phải đối mặt với sự thật rằng cô có khả năng chuyển đổi giới tính vào ban đêm và trở thành Ren, điều này khiến cho tâm trí cô bị hỗn loạn và trải qua nhiều khó khăn về tâm lý. Truyện khám phá sâu vào tâm lý của các nhân vật, từ cuộc sống ẩn dấu của Ren đến bí mật đen tối của mỗi người trong xã hội. Trong quá trình làm rõ vụ án mạng, Akane/Ren phải đối mặt với những căng thẳng tâm lý, bí ẩn khó lý giải và những bi kịch đầy nước mắt. Cuối cùng, câu chuyện chứa đựng thông điệp về sự đau khổ, tình yêu và sự hy sinh để phải trải qua đau đớn để hiểu rõ bản thân và những người xung quanh. Mayonaka no X Giten kết hợp giữa yếu tố tâm lý, bí ẩn và bi kịch mang lại cảm giác hấp dẫn và sâu sắc cho độc giả.